針對國科會已通過在沙崙瀕危草鴞棲息地設置『沙崙生態科學園區』籌設計畫，卻引發保育團體強烈反彈，擔心扼殺草鴞生存空間，且台南市當前已無工業用地取代該計畫開發，市議員吳禹寰29日要求市府在此開發案中不能沒有聲音，需重視保育團體意見，保住生態核心，在產業發展與生態保育之間取得平衡點創造雙贏。市長黃偉哲強調，市府已從去年9月就開始偵測沙崙草鴞活動，發現草鴞密集現身高鐵附近及西區往南5公里的二仁溪區域。他強調，保育工作認理不認親，也不能一廂情願，雖然保育團體不相信政府，但政府願意相信他們，也願意與他們坐下來就證據對話。

市議員吳禹寰表示，『沙崙生態科學園區』設在沙崙，總面積531公頃，創造3萬5千個就業機會，及2兆2437億元產值，對台南市的經濟發展助益非常大，地方無不引頸期盼，但也憂心會破壞當地的生態環境，尤其當地除了草鶚外，也是環頸雉、猛禽類、台灣野兔、白鼻心及蝙蝠等動物的主要棲地，根據學者專家長期在該地的偵測統計，保育類鳥種已高達159種。尤其俗稱貓頭鷹的草鶚，是台灣特有亞種，也是國內瀕臨絕種的保育類野生動物，全台數量不到500隻，大都集中在台灣西南區域，偏好在淺丘的草生地或農場耕地，也是唯一不在森林棲息的鳥種，牠們的食物是老鼠，因棲地過度開發，加上農藥使用及鼠藥毒害，甚至是鳥網與遊蕩犬的攻擊等傷害，草鶚數量越來越少。

吳禹寰強調，沙崙生態科學園區的開發主導權雖是國科會，但為了搶救沙崙生態，市府不能沒有聲音，必須主動站出來為生態把關，重視保育團體意見，對於國科會提出的當地的生態保育計畫，不能僅是點頭。而保育團體要求政府另外選址，但現今台南市並無合適工業區可容納，所以對保育團體擔心依國科會的綠地規劃，草鶚將來會面臨『路殺』威脅，因此建議廠區的硬體建設，應集中在園區的北側，讓南側靠近二仁溪的地帶完整，才能讓草鶚安全移動與覓食及棲息。

吳禹寰也對近幾個月來，從沙崙到歸仁圓環周邊，經常遭臭味入侵提出質詢。他說，臭味五花八門，有豬屎、雞屎及焚燒動物大體味道，當地居民被迫緊閉門窗，衣服也不敢晾曬外面，睡覺還要戴口罩，已嚴重干擾到生活，臭味並成為居民集體焦慮，尤其熱點之處又偵測不到臭味，或是稽查人員趕到現場，味道已消散，他的服務處電話更是接不完。他問環保局長，這些臭味來自何處？局長許仁澤說，風向若吹南風會有豬屎味，若吹北風則是雞屎味，沙崙周遭的畜牧業總計有52家。

吳禹寰建議市府用AI大數據追查或善用無人機稽查，以擴大巡查範圍並留下科學數據，打造一個異味防制機制，並成立跨局處平台與稽查小組，甚至長遠之計則以離牧為目標。農業局長李芳林說，該區域有14個敏感點，已向中央提報離牧計畫，經費高達7億元。