因應焚化處理操作及人事等成本持續增加，加上現行收費標準相較部分鄰近縣市偏低，恐形成跨縣市廢棄物運送誘因，增加城西焚化廠進場垃圾量及調度壓力。臺南市政府採分階段調整策略，透過合理費率反映實際處理成本，同時維持焚化處理量能與環境永續。

市府第一階段調整已於114年7月1日起實施，一般事業廢棄物每公噸由2,050元調高至3,000元，高熱值廢棄物則由每公噸3,500元調高至6,000元。目前正積極辦理第二階段調整作業，規劃一般事業廢棄物調升至每公噸3,600元，高熱值廢棄物調升至每公噸6,700元。全案調整後，預估每年可增加約1億元市庫收入。

環保局表示，調整費率的主要目的，在於合理反映焚化處理成本、平衡區域收費水準，以維持城西焚化廠穩定運作及整體垃圾處理量能。增加財政收益並非唯一考量。

環保局強調，費率修正的根本目的在於合理反映處理成本、平衡區域收費水準及維護環境永續量能，增加財政收益並非唯一考量。目前相關方案仍在法規會審議階段，實際定案之收費標準與正式實施日期，將待法定程序完備後另行對外公告。