台南市長黃偉哲為提升將軍區沿海青鯤鯓、馬沙溝兩處抽水站防洪功能，積極爭取並獲得內政部國土管理署同意納入前瞻計畫補助新臺幣5,700萬元(中央補助款4,446萬，市配合款1,254萬)，市府再增籌900萬元，總計投入6,600萬元辦理「青鯤鯓及馬沙溝抽水站設備更新工程」，提供市民更有保障及安全的居住環境。

水利局指出，去(113)年凱米颱風為將軍區帶來劇烈降雨，最大每小時82.5毫米，在長延時強降雨情況下，抽水站老舊機組因不堪長時間運轉影響抽排防洪能力造成局部淹水災情。凱米颱風過後，水利局即提報爭取青鯤鯓及馬沙溝抽水站設備更新工程，預計在青鯤鯓抽水站新增每秒1.8噸抽水量之電動豎軸抽水機1組及更新每秒1噸抽水量之沈水式抽水機2組，並將發電機更新提升為新站350KW 1組及舊站250KW 2組；馬沙溝抽水站則更新2組電動迴轉式撈污機、新增2組30HP沈水式抽水機，並將發電機從原本的250KW 2組更新提升為300KW(更新1組，後續增購1組)，以及外閘門整修以提升擋水功能。

水利局表示，該工程已於114年6月2日開工，預計於115年汛期前完工，更新之抽水機組即可投入抽水站防汛作業，透過抽水機組設備更新及新增、供電系統更新與閘門水密改善，以強化青鯤鯓及馬沙溝抽水站整體抽水量能。