衛福部長、疫情指揮中心指揮官陳時中曾說「不喜歡吃碗內看碗外」，如今卻接受民進黨徵召參選台北市長，被嗆「落跑指揮官」。陳時中第一時語出驚人表示，政務官是自由業，沒有任期，隨時可以來、隨時可以走，事後又改口澄清是當政務官「前」是自由業。對此，柯文哲12日開嗆，「我氣到不想講話」。

陳時中第一時間稱政務官是「自由業」，之後又澄清被誤解。柯文哲忍不住想砲轟，數度卻欲言又止，表示「不要講了」「我氣到不想講話」。他表示，北市府要做什麼事情都要準備很久，包括工作移交的細項等，「陳時中選不選我不介意，中央防疫指揮系統要怎麼重整才是重點。」

陳時中表示，「必須要把防疫工作階段性任務完成，把部長職務交接妥當，人民安心，我才能放心卸任，專心投入選戰。」柯文哲嗆，「那很奇怪啊！都還沒有準備好交接，民進黨就宣布參選，然後開始跑選舉行程，這實在是…」

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