丹娜絲颱風帶來的強風豪雨重創畜牧業，農業部公布114年丹娜絲颱風及0708、0728豪雨及楊柳颱風畜牧專案補協助辦法，期能減輕業者損失。台南市府農業局表示，鼓勵產業積極轉型升級，邀請業者分享畜牧場改建為現代化設施，以對抗未來天然災害。

農業局表示，此次風災加豪雨影響畜牧產品供需可能長達半年。農業部公佈的辦法可補助畜禽舍、堆肥舍、管理室或倉儲等設施的結構新、改、修建及畜牧設施等，市府會協助農民申辦，加速協助產業恢復生產，助業者早日度過難關。

農業局說，為強化產業競爭力，積極輔導畜牧場執行養豬百億基金計畫及禽舍現代化升級計畫，已改善許多畜牧場管理問題，減少人力成本及增加防疫安全。此外，也提升對抗極端氣候影響，保護室內畜禽及設備不受傷害。業者分享說，配合政府的轉型升級計畫進行改建，大幅降低風災的整體損失，也維持正常經營生產。

農業局提醒業者，此次風災導致傳統畜禽舍損毀比率高，農業部的畜牧專案補助，需於10月31日前向所轄各區公所提出申請。請受災畜牧場務必先留存受損設施的各角度照片數張，以利後續申請及審查時作為相關說明或佐證。也鼓勵受損改建的畜牧場，可配合補助規劃建置環保節能設施，把畜牧場升級轉型。