針對新竹縣市合併議題，縣長楊文科表達「贊成新竹縣市合併升格為第七都（直轄市）」立場。說明在當前《財政收支劃分法》及《地方行政機關組織準則》規範下，新竹縣市民眾遭受了相當不公平的待遇！
縣長楊文科指出，過去20多年來，新竹縣人口數從43萬3767人，大幅成長到57萬3385人；此外，大新竹地區高科技產業蓬勃發展，新竹縣市都是台灣的繳稅大戶，對於台灣稅收的貢獻，遠高於台北市以外的縣市。但新竹縣市繳給中央稅金，都被拿來建設到其他直轄市地區（六都）。目前各縣市中央統籌分配稅款比率，是依照民國88年1月25日修正通過之《財政收支劃分法》所擬定，六都直轄市佔了71.02％，其餘16個縣市分配剩餘的29.98％，新竹縣人口雖已大幅成長約14萬人，但僅能分配1.79％、約44億元，縣民平均獲配財源8050元，排名全國倒數第2低。
另外，公務機關的組織員額，也是依照民國88年訂定的《地方行政機關組織準則》分配，當時新竹縣的人口數為43萬3767人，核定的編制員額為1171人，即便目前新竹縣的人口數已大幅成長14萬餘人，甚至超越當年苗栗縣的人口數，但竹縣行政機關的編制員額都沒有調整，不僅非常不合理，更造成公務同仁在業務工作上龐大的負擔。
楊文科說，根據《地方制度法》的規定，要升格為直轄市有兩個條件，第一，人口數必須達到125萬人以上；第二，在政治、經濟、文化及都會區域發展上，有特殊需要之地區置之。新竹縣市是台灣矽谷，是台灣科技產業重鎮，可以成為台灣的科技首都；但是，目前的人口數約102萬餘人（新竹縣57萬3385人，新竹市45萬2807人），距離125萬還有點距離。
為了早日完成新竹縣市合併升格為第七都（直轄市）的目標，楊文科建議內政部提出《地方制度法》修正草案，將升格為直轄市的人口數門檻，降為100萬人。在沒有完成修法前，新竹縣市合併仍僅是省轄市，人（組織員額）跟錢（統籌分配款）都沒有增加，合併的效益不大。
