新冠肺炎疫情快速攀升，台南市長黃偉哲要求3月25-27日，一連三天，進行防疫管制演練。環保局不但成立疫情人力運用及辦公場所相關措施因應小組，同步配合市府啟動防疫演練，並針對對外洽公單位，於環保局大門口成立專責窗口，立即處理民眾申辦案件。
環保局長謝世傑指出，市長黃偉哲指示，對於疫情應該「超前部署、防疫優先、人員分流、空間整備」，為預防因應武漢肺炎疫情擴大，因此責成相關單位務必落實執行，避免可能導致辦公場所或人員遭隔離，影響公務運作，確保公務能正常運作，服務市民不中斷。因此環保局將民眾較多申辦之業務，於大門口成立專責辦理窗口，立即協助民眾申辦案件。
謝世傑表示，該局針對人員分流，空間整備已於日前模擬演練多次，25日起，即於環保局大門口設置相關業務的單一窗口，如資收大軍申請，廢四機聯單提送及空汙費繳納等民眾較常申辦之業務，專人專責立即處理，其他業務由單一洽公窗口，針對業務請相關承辦人員至大門口協助民眾處理，已於大門口同時4個服務櫃台同步服務，人員配置、場地實測，電話及相關電腦設備均已建置。
環保局表示，依黃市長指示，演練期間為3月25日（星期三）至3月27日（星期五），共有3天。
管制措施如下：
1、演練期間，洽公市民於大門口先行量測體溫後，於大門口專責櫃台受理。
2、外送物品或餐飲，統一於大門口領取，禁止進入局內。
3、受邀開會者（請攜帶開會通知單），相關事項拜會及廠商議價、開標者，請於洽公區「實名」登記，(請攜帶佐證證件)，始可進入環保局，進入環保局請隨時配戴口罩。
4、環保局同仁應憑識別證進出。
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