臺南市政府努力推動各項水質污染改善，跨縣市合作維護水域環境，經統計，轄內110年河川未（稍）受污染長度較109年增加6.4公里，多年來的持續作為讓水質日益轉好。接受環保署110年全國水污染防治考核榮獲優等獎肯定。
市長黃偉哲表示，在市政府各局處分工與努力下，110年轄內七大河川（八掌、急水、將軍、曾文、鹽水、二仁溪及臺南運河）不發臭（溶氧≥2mg/L）比率較109年提升2個百分點達92%，110年公共污水下水道普及率較109年提升2.47%，連帶提升整體民生污水處理率6.89%。相信臺南市的河川水質會愈來愈好。
為改善河川水質，市政府有許多積極措施，110年公告「臺南市餐飲業油水分離設施管理辦法」，112年1月起將嚴格要求300座位以上至500座位以下或營業面積1000至1500平方公尺之業者設置油水分離設施，以改善水域環境衛生。
臺南市政府爭取到中央5.48億元補助，辦理三爺溪上游排水截流暨虎尾寮水資源回收中心功能改善及擴建工程，截流處理永康區部分民生污水，預計112年完工後能將已處理的乾淨水源回放10,000公噸至網寮橋測站，使水質由嚴重污染降至中度污染。
積極輔導畜牧場糞尿肥分資源化，柳營區八翁酪農區53家畜牧場已全部資源化，創全國典範，下游台19甲急水溪橋測站嚴重污染指數由7.2下降為6.3，已有顯著成果。又爭取到中央補助近5千萬元在八翁酪農區建置畜牧糞尿集中處理場，預期112年完工後可改善台19甲急水溪橋測站水體環境。
另外，市府定期召開河川及海洋污染防治小組會議，針對水質及改善規劃進行滾動式檢討。也跨機關與高雄市環保局在枯水期間同步稽查二仁溪流域，推動水域環境改善。
環保局長謝世傑指出，環保局與市府相關單位將持續努力改善水質，包括對屢遭陳情之工業區加強廢水排放巡稽查、河岸水面佈設垃圾攔除設備等、要求無廢水處理廠的工業區加快改善步伐等，以期早日達到水清魚現願景。
